佛教慧因法師紀念中學創立於1987年，為佛聯會開辦之第十一所政府資助男女中學，亦為長洲第一所由佛教團體主辦之學校。 佛聯會為紀念澳門普濟禪院己故大德慧因法師慈悲度生之弘願，興學育才之遺志，並將學校命名佛教慧因法師紀念中學，以彰盛德，永垂景仰。